Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERFP50548 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERFP50548 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERFP50548 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms