Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRMP28827 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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