Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP11P24347 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MMP11P24347 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MMP11P24347 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MMP11P24347 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP11P24347 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MMP11P24347 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MMP11P24347 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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