Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPREP23469 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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