Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms