Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCNAP12004 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCNAP12004 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCNAP12004 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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