Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRATO95237 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRATO95237 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRATO95237 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRATO95237 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms