Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms