Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PATL2C9JE40 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PATL2C9JE40 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms