Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E2F8A0AVK6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E2F8A0AVK6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms