Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP35Q9P2H5 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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