Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2Q9BX26 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms