Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIOK2Q9BVS4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms