Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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USP9XQ93008 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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USP9XQ93008 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USP9XQ93008 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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