Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PEX13Q92968 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms