Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD1Q6UXZ0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms