Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FAM46CQ5VWP2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms