Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ODF2Q5BJF6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ODF2Q5BJF6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms