Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX2Q3B8N5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms