Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FSCN1Q16658 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms