Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCN9AQ15858 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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