Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITSN1Q15811 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms