Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC000078.1-201ENST00000420617 682 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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RYR3Q15413 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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