Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAB39AQ14964 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms