Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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DDX39BQ13838 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DDX39BQ13838 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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