Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 CBR3-AS1-204ENST00000453159 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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MKRN4PQ13434 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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