Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CACNB2Q08289 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms