Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIN1Q05586 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIN1Q05586 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms