Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms