Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA7P31268 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA7P31268 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms