Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CALB2P22676 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CALB2P22676 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms