Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GFAPP14136 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFAPP14136 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms