Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HOXD8P13378 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms