Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NIPSNAP2O75323 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP2O75323 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms