Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIN3BO75182 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms