Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
UBDO15205 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBDO15205 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBDO15205 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms