Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CEP290O15078 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CEP290O15078 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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CEP290O15078 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEP290O15078 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CEP290O15078 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CEP290O15078 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP290O15078 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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CEP290O15078 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CEP290O15078 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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