Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLXNB3Q9ULL4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms