Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS29Q9UBQ0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS29Q9UBQ0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms