Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COPG2Q9UBF2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COPG2Q9UBF2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms