Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00597Q9H2U6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms