Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM54Q9BYV2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms