Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFT27Q9BW83 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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