Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BHMTQ93088 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms