Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBE2Q1Q7Z7E8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms