Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF550Q7Z398 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZNF550Q7Z398 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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