Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHA9Q7RTU4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms