Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LETMD1Q6P1Q0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms