Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC96Q2M329 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms