Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM187BQ17R55 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms